######################################## # Program: garnier # Rundate: Fri Nov 08 15:46:41 2002 # Report_format: seqtable # Report_file: report.seqtable ######################################## #======================================= # # Sequence: 100K_RAT from: 1 to: 889 # HitCount: 206 # # DCH = 0, DCS = 0 # # Please cite: # Garnier, Osguthorpe and Robson (1978) J. Mol. Biol. 120:97-120 # # #======================================= Start End helix sheet turns coil Sequence 1 6 H . . . MMSARG 7 7 . . T . D 8 17 H . . . FLNYALSLMR 18 20 . . . C SHN 21 25 . . T . DEHSD 26 28 . E . . VLP 29 38 H . . . VLDVCSLKHV 39 40 . E . . AY 41 50 H . . . VFQALIYWIK 51 53 . . . C AMN 54 55 . . T . QQ 56 62 . . . C TTLDTPQ 63 77 H . . . LERKRTRELLELGID 78 78 . . . C N 79 85 H . . . EDSEHEN 86 88 . . T . DDD 89 89 . . . C T 90 91 H . . . SQ 92 93 . E . . SA 94 96 . . . C TLN 97 99 . . T . DKD 100 100 . . . C D 101 101 H . . . E 102 103 . . . C SL 104 107 H . . . PAET 108 109 . . T . GQ 110 112 . . . C NHP 113 113 . . T . F 114 114 . E . . F 115 121 . . T . RRSDSMT 122 123 . E . . FL 124 125 . . T . GC 126 130 . . . C IPPNP 131 131 . . T . F 132 133 . E . . EV 134 144 H . . . PLAEAIPLADQ 145 145 . . . C P 146 146 . . T . H 147 152 . . . C LLQPNA 153 154 H . . . RK 155 156 . E . . ED 157 158 . . T . LF 159 161 . . . C GRP 162 164 . . T . SQG 165 165 . . . C L 166 167 . E . . YS 168 173 . . T . SSAGSG 174 174 . . . C K 175 179 . E . . CLVEV 180 209 H . . . TMDRNCLEVLPTKMSYAANLKNVMNMQNRQ 210 213 . . . C KKAG 214 224 H . . . EDQSMLAEEAD 225 225 . . T . S 226 231 . . . C SKPGPS 232 248 H . . . AHDVAAQLKSSLLAEIG 249 251 . . . C LTE 252 253 . . T . SE 254 255 . . . C GP 256 259 . . T . PLTS 260 261 . E . . FR 262 266 . . T . PQCSF 267 269 . E . . MGM 270 277 H . . . VISHDMLL 278 279 . . T . GR 280 281 H . . . WR 282 286 . . . C LSLEL 287 293 H . . . FGRVFME 294 299 . . . C DVGAEP 300 300 . . T . G 301 301 . . . C S 302 304 . E . . ILT 305 305 H . . . E 306 307 . . . C LG 308 326 H . . . GFEVKESKFRREMEKLRNQ 327 328 . . . C QS 329 329 . . T . R 330 331 . . . C DL 332 334 . E . . SLE 335 343 H . . . VDRDRDLLI 344 348 . E . . QQTMR 349 349 . . T . Q 350 350 . . . C L 351 359 . . T . NNHFGRRCA 360 361 . . . C TT 362 369 H . . . PMAVHRVK 370 373 . E . . VTFK 374 376 . . . C DEP 377 378 . . T . GE 379 382 . . . C GSGV 383 388 . E . . ARSFYT 389 395 H . . . AIAQAFL 396 396 . . . C S 397 399 . . T . NEK 400 400 . . . C L 401 402 . . T . PN 403 403 H . . . L 404 404 . E . . D 405 405 H . . . C 406 407 . E . . IQ 408 412 . . T . NANKG 413 414 . . . C TH 415 420 . E . . TSLMQR 421 428 . . . C LRNRGERD 429 438 H . . . REREREREMR 439 440 . . T . RS 441 445 . . . C SGLRA 446 446 . . T . G 447 447 . . . C S 448 462 . . T . RRDRDRDFRRQLSID 463 465 . . . C TRP 466 466 . . T . F 467 468 . . . C RP 469 469 . . T . A 470 470 . . . C S 471 472 . . T . EG 473 473 . . . C N 474 476 . . T . PSD 477 481 . . . C DPDPL 482 487 H . . . PAHRQA 488 488 . . . C L 489 491 . . T . GER 492 493 . . . C LY 494 495 . . T . PR 496 500 . E . . VQAMQ 501 508 H . . . PAFASKIT 509 512 . E . . GMLL 513 543 H . . . ELSPAQLLLLLASEDSLRARVEEAMELIVAH 544 546 . . . C GRE 547 549 . . T . NGA 550 550 . . . C D 551 555 . E . . SILDL 556 557 H . . . GL 558 559 . . . C LD 560 568 H . . . SSEKVQENR 569 572 . . T . KRHG 573 574 . . . C SS 575 575 . . T . R 576 582 . E . . SVVDMDL 583 590 . . T . DDTDDGDD 591 592 . . . C NA 593 597 . E . . PLFYQ 598 602 . . T . PGKRG 603 605 . E . . FYT 606 607 . . . C PR 608 609 . . T . PG 610 612 . . . C KNT 613 613 . E . . E 614 616 H . . . ARL 617 624 . . T . NCFRNIGR 625 630 . E . . ILGLCL 631 634 . . T . LQNE 635 636 . E . . LC 637 638 . . T . PI 639 642 H . . . TLNR 643 649 . E . . HVIKVLL 650 651 . . T . GR 652 653 . . . C KV 654 655 . . T . NW 656 656 . . . C H 657 660 . . T . DFAF 661 664 . . . C FDPV 665 672 H . . . MYESLRQL 673 675 . E . . ILA 676 680 . . . C SQSSD 681 699 H . . . ADAVFSAMDLAFAVDLCKE 700 702 . . T . EGG 703 704 . . . C GQ 705 708 . E . . VELI 709 712 . . T . PNGV 713 713 . . . C N 714 718 . E . . IPVTP 719 719 . . T . Q 720 724 . E . . NVYEY 725 748 H . . . VRKYAEHRMLVVAEQPLHAMRKGL 749 751 . E . . LDV 752 756 . . . C LPKNS 757 767 H . . . LEDLTAEDFRL 768 768 . E . . L 769 769 . . T . V 770 770 . . . C N 771 772 . . T . GC 773 774 . . . C GE 775 783 . E . . VNVQMLISF 784 791 . . . C TSFNDESG 792 801 H . . . ENAEKLLQFK 802 804 . . T . RWF 805 812 . . . C WSIVERMS 813 817 H . . . MTERQ 818 818 . . T . D 819 822 . E . . LVYF 823 824 . . T . WT 825 832 . . . C SSPSLPAS 833 833 H . . . E 834 836 . . T . EGF 837 839 . . . C QPM 840 841 . . T . PS 842 845 . E . . ITIR 846 846 . . . C P 847 850 . . T . PDDQ 851 852 . . . C HL 853 857 . . T . PTANT 858 865 . E . . CISRLYVP 866 868 . . T . LYS 869 882 H . . . SKQILKQKLLLAIK 883 887 . . T . TKNFG 888 889 . E . . FV #--------------------------------------- # # Residue totals: H:364 E:149 T:191 C:185 # percent: H: 41.7 E: 17.1 T: 21.9 C: 21.2 # #---------------------------------------